河蟹為雌雄異體，區別性別的特征主要是腹臍。幼蟹階段，性腺尚未分化，腹臍基本上都呈三角形。用早苗或幼蟹培育蟹種的池內，如餌料豐盛，當年可養成小規格的成蟹，性腺已成熟；一般的蟹性腺二齡開始發育，副性征明顯從腹臍上區分，團臍為雌蟹，尖臍為雄蟹。
雌蟹生殖器官由卵巢和輸卵管所組成。成熟時卵巢飽滿，分左右兩葉分布在體內兩側并相互融聯?？擅黠@地見到紫醬色或豆沙色的卵粒．輸卵管較短，末端有一對貯精囊，是交配后貯存精子的白色囊狀組織。雌孔開口在第五節腹甲上，上有一個三角形骨質突起，是交配時雄蟹交接器掛鉤之處。
雄性生殖器官由精巢和輸精管組成，分左右兩葉，乳白色，在心臟和胃之間融接。輸精管在精巢的下方，和副性腺匯合后開口于腹甲第七節上，開口處有陰莖，腹肢有兩對交接器，用來交配輸精。